شناسایی قارچ های بیمارگرحشرات در منطقه ی خسروشهر با استفاده از تجزیه و تحلیل نسب شتاختی ترادف its-rdna

در طول سال های 1391 و 1392 و برای اولین بار، نمونه برداری از خاک منطقه ی خسروشهر در شمال غرب ایران با هدف مطالعه پراکنش و تنوع گونه ای مورد بررسی قرار گرفت. نمونه های خاکی جمع آوری شده با استفاده از روش تله گذاری با لارو پروانه ی galleria mellonella (galleria bait method) بررسی گردید. ناحیه ی its-rdna با استفاده از آغازگرهای its4 و its5 تکثیر و سپس توالی یابی گردید. جستجوی بلاست برای یافتن ترادف های هومولوگ انجام و سپس نام هومولوگ ترین جدایه برای نامگذاری جدایه مورد بررسی استفاده گردید. ترادف its-rdna جدایه های مورد مطالعه با استفاده از نرم افزاز chromas lite ویرایش و سپس با استفاده از نرم افزار clustal x 2.1 و به همراه ترادف های هومولوگ انتخاب شده از ncbi زیرهم چینی گردید. تجزیه و تحلیل های نسب شناختی بر اساس روش های maximum parsimony، maximum likelihood و neighbor-joiningبرای مشخص بودن جایگاه رده بندی جدایه ها بر اساس اطلاعات حاصل از ترادف its-rdna انجام گرفت.